Первоначально церковь выглядела более скромно — у нее не было колокольни и трапезная имела другой вид. Достройка и перестройка прошли в начале 1850-х годов, причем, вполне вероятно, что в работах принимал участие архитектор Михаил Иванович Бове. В 1855 на средства прихожан была пристроена колокольня и расширена трапезная, а год спустя — сторожка. В 1859 году были освящены престолы в трапезной — Рождества Богородицы и Святителя Николая Чудотворца.
Позже в церкви появился пятиярусный иконостас. С 1910 по 1937 год настоятелем храма Иоанна Златоуста был свящяенник Александр Цветков. 21 сентября 1937 года его расстреляли на полигоне НКВД «Бутово». В том же году храм закрыли. Благодаря находчивости старосты села Новлянское, все убранство храма сохранилось. Женщина и ее помощники засыпали зерном притвор, так что войти во внутрь храма было нельзя.
